莲子鲜可生食，也可做汤菜、甜食、糕点，其味清香，营养丰富。干莲子中，碳水化合物的含量高达62％，蛋白质的食量为16.6％，脂肪、钙、铁及维生素B1、B2和胡萝ト素的含量也相当丰富，是老少皆宜的健康食物。

莲子是一味很有价值的中药，为滋补元气之珍品，尤以湖南湘莲、福建建莲的莲子为上品。药用时去皮，故又称“莲肉”。其味甘、涩，性平，入心、肾、脾三经，所以莲子有补脾、益肺、养心、固精、补虚、止血等功效。生可补心脾，熟能厚肠胃，适用于心悸、失眠、体虚、遗精、白带过多、慢性腹泻等症。它的特点是既能补，又能固，因此可补中止泻，安中固精。临床观察有镇静作用，所含黄心树宁碱对鼻咽癌有一定的抑制作用。

莲心，味极苦，吃莲子时勿将其去除，前人有诗曰:“莫嫌一点苦，便拟弃莲心。”正是这颗“苦心”，有很大的药用价值。莲心可清心去热，敛液止汗清热养神，止血固精。莲心里含莲心碱、荷叶碱、木犀甙、金丝桃甙等，有清热、固精、安神、强身降压之效，对高热引起的烦躁不安、神志不清和梦遗等症有辅助治疗作用。现代医学证明:莲心水煎液能提高组织胺的浓度，使外周血管扩张，具有降压作用;莲心中所含的生物碱还有强心作用。

莲子之外，还有一种“石莲子”，又名甜莲子，是莲子老于莲房后，坠入淤泥，久埋变得坚黑如石。其味甘性寒，有清心除烦、清热利湿、健脾开胃的功效。中医常用于治疗口苦咽干、烦热、痢疾等症，并有解忧郁、清热作用。